讨论

APP项目动态化讨论

zhangfanglin — Sun, 25 Jun 2023 10:33:04 GMT

需求：

APP可实现配置与发布，其中配置包含表单参数（生信参数），结果以及组图，图需要依赖的组件，可自由配置。
云工具配置与发布过程：

结论：

前端：

开发共有组件：

1、左侧表单组件方式开发（后边会给出数据JSON或者YAML文件格式指定）
2、右侧相关的TAB页（后边会给出数据JSON或者YAML文件格式指定）
3、每个具体的图相关组件（类似气泡图、散点图等组件）
4、组件相关的工具条

组件引用

1、需要下载开发的相关依赖包
2、后续开发需要引用相应的组件，表单、图表、 TAB
3、默认调用当前APP相关的基础接口

后端：

相关依赖包

1、对接平台python包
2、公共上传服务
3、读取前端配置文件

后端开发规范

1、每个项目会默认生成基础包
2、引入相应的包

公共文件、公共数据集

zhangfanglin — Thu, 06 Apr 2023 03:31:31 GMT

参会人员：王超、张方琳。
讨论结果：

公共文件
公共文件存储时可新增Metadata信息，其中包含文件、文件夹都可以记录Metadata。
流程结果（创建数据库的流程，或者其他流程）可以新增到公共文件中，后续管理员自行新增Metadata。
公共数据集
使用ckanAPI功能对接平台。
前端页面参考kaggle界面卡片类型。

应用商店-流程仓库入参讨论

zhangfanglin — Thu, 23 Mar 2023 11:09:44 GMT

注释：
docker：docker地址
appname：软件名称
value：数据值
type：参数类型（input输入，output输出）
default：默认值
title：软件名称（中）
description：介绍
category：入参类型

{ name: '项目文件', value: 'project_param' }, { name: '元数据文件', value: 'metadata' }, { name: '元数据指定列', value: 'metadata_item' }, { name: '公共文件数据', value: 'public_file_param' }, { name: '公共数据库', value: 'public_database' }, { name: '系统参数', value: 'system_parameter' }, { name: '其他参数', value: 'parameter' },

data_type：数据库类型

{ name: 'Array[String]', value: 'Array[String]' }, { name: 'Array[Int]', value: 'Array[Int]' }, { name: 'Array[Float]', value: 'Array[Float]' }, { name: 'Array[File]', value: 'Array[File]' }, { name: 'String', value: 'String' }, { name: 'Int', value: 'Int' }, { name: 'Float', value: 'Float' }, { name: 'File', value: 'File' }, { name: 'Boolean', value: 'Boolean' }, { name: 'Enum', value: 'Enum' },

options：枚举选项值
rule：正则验证参数
file_types：入参文件要求
is_quick_parameter：是否为便捷参数（快速启动用）
is_required：是否是必选

genostackV3-公共文件数据讨论

zhangfanglin — Fri, 03 Mar 2023 03:58:38 GMT

参会人员：王超、刘茜茜、张方琳。

文件数据包含内容结论：

1、数据库名称（只能支持英文）
2、别名（支持中文，显示名称）
3、数据库路径
4、数据库类型（bwa、samtools、makeDB、tabix、kraken）
5、标签（tag）数据来源：字典，后续根据需求定义
6、简介（可选）
7、创建时间、修改时间

流程入参结论：
选择文件数据库

1、 path/dbname
2、可以选择到具体文件