<![CDATA[数据库]]>http://an.forum.genostack.com/category/35RSS for NodeSat, 13 Jun 2026 09:29:37 GMTTue, 31 May 2022 06:13:36 GMT60<![CDATA[ncbi datasets]]>https://www.ncbi.nlm.nih.gov/labs/virus/vssi/#/
NCBI virus

]]>http://an.forum.genostack.com/topic/677/ncbi-datasetshttp://an.forum.genostack.com/topic/677/ncbi-datasetsTue, 31 May 2022 06:13:36 GMT<![CDATA[按照物种大类下载NCBI的序列]]>https://www.ncbi.nlm.nih.gov/Taxonomy/taxonomyhome.html/index.cgi?chapter=statistics&uncultured=hide&unspecified=hide

从taxonomy入口 可以根据这些大类的taxon id 搜索ncbi 核酸库 然后下载fasta文件

]]>http://an.forum.genostack.com/topic/676/按照物种大类下载ncbi的序列http://an.forum.genostack.com/topic/676/按照物种大类下载ncbi的序列Tue, 31 May 2022 03:47:27 GMT<![CDATA[中国物种库]]>http://www.sp2000.org.cn/ 中国物种库 这个里有一些翻译

]]>http://an.forum.genostack.com/topic/635/中国物种库http://an.forum.genostack.com/topic/635/中国物种库Mon, 09 May 2022 03:08:17 GMT<![CDATA[The European Bioinformatics Institute (EMBL-EBI) in 2021]]>https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC8690175/

]]>http://an.forum.genostack.com/topic/622/the-european-bioinformatics-institute-embl-ebi-in-2021http://an.forum.genostack.com/topic/622/the-european-bioinformatics-institute-embl-ebi-in-2021Thu, 14 Apr 2022 09:35:26 GMT<![CDATA[国家基因组科学数据中心]]>https://ngdc.cncb.ac.cn/ncov/
https://ngdc.cncb.ac.cn/
国家基因组科学数据中心
面向我国人口健康和社会可持续发展的重大战略需求，国家基因组科学数据中心（NGDC），作为国家生物信息中心（CNCB）的重要组成，建立生命与健康大数据汇交存储、安全管理、开放共享与整合挖掘研究体系，研发大数据前沿交叉与转化应用的新方法和新技术，建成支撑我国生命科学发展、国际领先的基因组科学数据中心。

]]>http://an.forum.genostack.com/topic/578/国家基因组科学数据中心http://an.forum.genostack.com/topic/578/国家基因组科学数据中心Tue, 15 Mar 2022 06:05:06 GMT<![CDATA[NCBI]]>https://physiology.med.cornell.edu/faculty/skrabanek/lab/angsd/lecture_notes/Sullivan2017_NCBI_sequenceArchives.pdf

对NCBI各个库的解释

]]>http://an.forum.genostack.com/topic/535/ncbihttp://an.forum.genostack.com/topic/535/ncbiThu, 27 Jan 2022 02:19:10 GMT<![CDATA[NCBImeta: efficient and comprehensive metadata retrieval from NCBI databases]]>https://www.theoj.org/joss-papers/joss.01990/10.21105.joss.01990.pdf
https://github.com/ktmeaton/NCBImeta
Efficient and comprehensive metadata acquisition from the NCBI databases (includes SRA).

]]>http://an.forum.genostack.com/topic/534/ncbimeta-efficient-and-comprehensive-metadata-retrieval-from-ncbi-databaseshttp://an.forum.genostack.com/topic/534/ncbimeta-efficient-and-comprehensive-metadata-retrieval-from-ncbi-databasesWed, 26 Jan 2022 11:15:09 GMT<![CDATA[ENA 培训材料]]>https://ena-docs.readthedocs.io/en/latest/index.html

]]>http://an.forum.genostack.com/topic/533/ena-培训材料http://an.forum.genostack.com/topic/533/ena-培训材料Wed, 26 Jan 2022 10:41:39 GMT<![CDATA[https://nmdc.cn/]]>国家微生物科学数据中心

]]>http://an.forum.genostack.com/topic/530/https-nmdc-cnhttp://an.forum.genostack.com/topic/530/https-nmdc-cnTue, 25 Jan 2022 07:02:29 GMT<![CDATA[http://plasmodb.org/]]>https://onlinelibrary.wiley.com/doi/pdf/10.1111/j.1462-5822.2005.00553.x

]]>http://an.forum.genostack.com/topic/509/http-plasmodb-orghttp://an.forum.genostack.com/topic/509/http-plasmodb-orgFri, 31 Dec 2021 16:14:33 GMT<![CDATA[SRA]]>https://metasra.biostat.wisc.edu/?species=human&assay=RNA-seq
e2c3726f-b830-4270-a5c8-a7c2d6bfb21b-image.png

https://academic.oup.com/bioinformatics/article/33/18/2914/3848915?login=false

]]>http://an.forum.genostack.com/topic/507/srahttp://an.forum.genostack.com/topic/507/sraFri, 31 Dec 2021 15:13:04 GMT<![CDATA[GEO 数据库]]>https://imageo.genyo.es/#
对GEO进行meta-analysis分析
28bbb206-75be-4697-af97-f51ea331bce4-image.png

]]>http://an.forum.genostack.com/topic/506/geo-数据库http://an.forum.genostack.com/topic/506/geo-数据库Fri, 31 Dec 2021 13:59:19 GMT<![CDATA[构建本地GenBank数据库]]>http://scikit-bio.org/docs/0.5.2/generated/skbio.io.format.genbank.html

]]>http://an.forum.genostack.com/topic/487/构建本地genbank数据库http://an.forum.genostack.com/topic/487/构建本地genbank数据库Mon, 13 Dec 2021 06:37:11 GMT