暗能星系
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      anneng 最后由 anneng 编辑

      http://resources.qiagenbioinformatics.com/manuals/clcgenomicsworkbench/current/index.php?manual=Introduction_CLC_Genomics_Workbench.html&_ga=2.177253026.680633013.1608617300-1726085980.1608170681

      凯杰的一个商业软件　CLC工作台　如果能把这个工具中的所有功能都web化到genostack中　将是很大的一个跨越
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      • A
        anneng 最后由 anneng 编辑

        https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/gdv/browser/help/
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        https://www.ncbi.nlm.nih.gov/tools/sviewer/embedding-api/

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          anneng 最后由 编辑

          http://etetoolkit.org/

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          • A
            anneng 最后由 编辑

            https://wikis.univ-lille.fr/bilille/_media/report_genome_browser_bilille_jul2019.pdf

            对比文档

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              anneng 最后由 编辑

              https://github.com/iobio/gene.iobio

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              • A
                anneng 最后由 anneng 编辑

                https://github.com/epam/NGB
                e2cf8308-6dcc-48ee-b9ef-dda01fd9f605-image.png
                功能不错 可以看SV

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                • A
                  anneng 最后由 编辑

                  https://bamsnap.readthedocs.io/en/latest/gallery.html

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                  • A
                    anneng 最后由 编辑

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                    dnanexus的这些工具也挺好的

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                    • A
                      anneng 最后由 编辑

                      http://d3gb.usal.es/index.html
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                      Z 1 条回复 最后回复 回复 引用 0
                      • A
                        anneng 最后由 编辑

                        https://www.snapgene.com/features/convert-file-formats/genbank/
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                        • A
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                          https://www.geneious.com/features/import-export-sequence-data/

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                          • A
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                            https://github.com/jonathancrabtree/Circleator

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                            • A
                              anneng 最后由 编辑

                              http://apollo11.isto.unibo.it/software/
                              https://www.researchgate.net/publication/8559960_GeneRecords_A_relational_database_for_GenBank_flat_file_parsing_and_data_manipulation_in_personal_computers

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                              • A
                                anneng 最后由 编辑

                                https://github.com/TeselaGen/openVectorEditor
                                3e08bf33-34e6-4ac3-b1ad-39c72f6b4b5e-image.png

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                                  http://ugene.net/
                                  78e2260e-b879-4440-80af-eb977cfd30c9-image.png

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                                    anneng 最后由 编辑

                                    https://github.com/calipho-sib/sequence-viewer

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                                    • A
                                      anneng 最后由 编辑

                                      https://github.com/Lattice-Automation/seqviz
                                      0e1c35e1-7da1-4668-9d63-b4c7c6ddb8bc-image.png

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                                        anneng 最后由 编辑

                                        https://github.com/cmdcolin/awesome-genome-visualization

                                        这个项目对常见的浏览器做了总结 非常值得看看

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                                        • Z
                                          zhangfanglin @anneng 最后由 anneng 编辑

                                          @anneng https://igv.org/ https://github.com/igvteam/igv.js#igvjs

                                          IGV_Tutorial_Long_BroadInstitute.pdf

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                                          • A
                                            anneng 最后由 编辑

                                            https://thekaplanlab.github.io/
                                            msa的浏览器 可以用于多序列比对的场合
                                            30ec45bc-f738-46dd-ba27-44847ea0ff0d-image.png

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