<![CDATA[16S 微生物数据分析]]>https://www.nature.com/articles/npjbiofilms20164
A perspective on 16S rRNA operational taxonomic unit clustering using sequence similarity
对16S中的OTU 方法进行了综述 OTU是根据序列相似性（通常为97%）将reads进行分组的方法 这样做可以把大量的reads分成较少的组 然后每个组取一条代表序列进行下游分析 例如物种鉴定 多序列比对和进化树构建

文章中OTU 方式提出了一些质疑

进化树部分 使用了RDP数据库 pasta(内部也用了mafft)多序列比对 RAxML树

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