<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?><rss xmlns:dc="http://purl.org/dc/elements/1.1/" xmlns:content="http://purl.org/rss/1.0/modules/content/" xmlns:atom="http://www.w3.org/2005/Atom" version="2.0"><channel><title><![CDATA[布鲁氏菌分析]]></title><description><![CDATA[<p dir="auto">4.4 单菌拼接分析软件<br />
4.4.1图形化操作界面，无需命令行输入，从下机数据到结果报告仅需一键式操作，无需专业生物信息学知识；<br />
4.4.2软件内嵌服务器，软硬件完美搭配，计算能力高效；<br />
4.4.3 功能：对菌株进行基因组测序，对其进行遗传学层面的分析，适用于分离培养菌株的测序原始数据的分析，包括质控、拼接和基因注释；<br />
4.4.4 对双端测序结果进行分析，对含有不确定碱基、读段中含有低质量值碱基、读段中含有接头序列等测序数据进行质量控制；<br />
4.4.5 可对菌株进行结构预测，非编码RNA序列注释，核糖体RNA注释，转运RNA注释，小RNA注释；<br />
4.4.6 具有耐药、抗性基因和质粒注释统计：可通过预测得到的基因和功能基因数据库做比对，获得目标菌株的基因注释功能，包含KEGG数据库、VFDB毒力因子数据库，CARD抗性基因数据库，COG直系同源蛋白数据库，抗性基因以柱状图显示丰度；<br />
4.4.7 具有细菌基因组拼接结果导出功能；<br />
4.4.8数据库整合超过8000种水平微生物的基因组序列，超过15000种种水平微生物的分类标记基因序列；<br />
4.4.9直接识别关键位点的变异；结合从头组装和比对参考序列两种算法，结果更可靠；动态展示reads比对和覆盖情况；提供后续个性化数据分析服务；<br />
4.4.10下机数据自动完成布鲁氏菌全基因组序列拼接；自动生成布鲁氏菌基因组溯源进化树；用户可以自主添加序列信息，从而生成新的进化树；数据结果自动生成布鲁氏菌地区特异性亚型注释，无需进行二次分析；<br />
4.4.11对布鲁氏菌进行基因组测序后，能够利用布鲁氏菌基因组多套核心基因集进行分子分型。<br />
4.4.12基因组测序后，能够对测序结果进行初步质控，对含有不确定碱基、读段中含有低质量值碱基、读段中含有接头序列等测序数据进行质量评估并进行清洗；<br />
4.4.13 能够对基因组进行质量评估，能够对布鲁氏菌基因组进行基因预测并做基因注释；<br />
4.4.14 能够进行布鲁氏菌拼接结果导出；<br />
4.4.15 能够对布鲁氏菌进行耐药基因、抗性基因和质粒进行注释和统计；<br />
4.4.16 软件具有国家版权局颁发的计算机软件著作权登记证书；<br />
4.5宏基因组未知病原分析软件<br />
4.5.1从下机数据到结果报告仅需一键式操作，操作界面具有图形界面，按钮式操作，易用性强，无需掌握Linux命令和编程语言，无需专业生物信息学知识；<br />
4.5.2宿主数据库至少包含人、猪、山羊、绵羊、小鼠、大鼠、鲤鱼、家鹅、鸡、鸭、牛、猫、狗、兔宿主数据；同时，支持定制化开发更多宿主物种；；<br />
4.5.3可自动计算覆盖度和深度，有效去除假阳性；既可单独对RNA的宏转录组测序数据进行分析，也可单独对DNA的宏基因组测序数据进行分析，还能同时对样本的RNA宏转录组以及DNA宏基因组测序数据进行分析，能解决背景微生物的干扰，对样本进行更加准确的病原微生物鉴定，并找出活跃表达的致病性微生物；<br />
4.5.4 可同时检测≥8000种病毒，≥9000种支原体和细菌，≥2000种真菌，≥12种寄生虫；内含≥300种常见病原注释信息，并且用户可自定义加入病原，有利于常见病原的识别<br />
4.5.5提供结果数据的reads数目做图统计功能，相对reads做图统计功能，物种树分析功能<br />
4.5.6提供结果报告图片和病原拼接序列结果的导出功能，用于未知病原体鉴定；软件内嵌服务器，软硬件完美搭配，计算能力高效；<br />
4.5.7 可兼容二代测序和三代测序的下机数据，实现二代测序联合三代测序数据分析功能，更适合细菌基因组拼接；<br />
4.5.8软件具有国家版权局颁发的计算机软件著作权登记证书；<br />
4.6扩增子分析软件<br />
4.6.1图形化操作界面，无需命令行输入，从下机数据到结果报告仅需一键式操作，无需专业生物信息学知识；<br />
4.6.2软件内嵌服务器，软硬件完美搭配，计算能力高效；<br />
4.6.3分析结果中包含样品中含有何种微⽣物；<br />
4.6.4分析结果包含样品中微⽣物的序列数， 即各种微⽣物的相对丰度；<br />
4.6.5提供界门纲⽬科属种七个级别的群落结构组成柱状图；<br />
4.6.6提供Alpha 多样性图形化分析结果；<br />
4.6.7提供基于 OTU 和进化树的⽣物种类对环境异质性的反应的Beta 多样性图形化分析结果；<br />
4.6.8提供OTU 聚类及物种信息注释；<br />
4.6.9提供OTU 序列及物种信息表格；<br />
4.6.10软件具有国家版权局颁发的计算机软件著作权登记证书；<br />
4.4 单菌拼接分析软件<br />
4.4.1图形化操作界面，无需命令行输入，从下机数据到结果报告仅需一键式操作，无需专业生物信息学知识；<br />
4.4.2软件内嵌服务器，软硬件完美搭配，计算能力高效；<br />
4.4.3 功能：对菌株进行基因组测序，对其进行遗传学层面的分析，适用于分离培养菌株的测序原始数据的分析，包括质控、拼接和基因注释；<br />
4.4.4 对双端测序结果进行分析，对含有不确定碱基、读段中含有低质量值碱基、读段中含有接头序列等测</p>
]]></description><link>http://an.forum.genostack.com/topic/737/布鲁氏菌分析</link><generator>RSS for Node</generator><lastBuildDate>Sat, 13 Jun 2026 14:28:28 GMT</lastBuildDate><atom:link href="http://an.forum.genostack.com/topic/737.rss" rel="self" type="application/rss+xml"/><pubDate>Thu, 28 Jul 2022 10:15:44 GMT</pubDate><ttl>60</ttl><item><title><![CDATA[Reply to 布鲁氏菌分析 on Thu, 28 Jul 2022 11:48:44 GMT]]></title><description><![CDATA[<p dir="auto"><a href="https://github.com/B-UMMI/INNUca" rel="nofollow ugc">https://github.com/B-UMMI/INNUca</a><br />
<img src="/assets/uploads/files/1659008919341-6d089cdf-0e9e-4cad-925a-321e3bd0bf4a-image.png" alt="6d089cdf-0e9e-4cad-925a-321e3bd0bf4a-image.png" class=" img-responsive img-markdown" /></p>
]]></description><link>http://an.forum.genostack.com/post/1756</link><guid isPermaLink="true">http://an.forum.genostack.com/post/1756</guid><dc:creator><![CDATA[anneng]]></dc:creator><pubDate>Thu, 28 Jul 2022 11:48:44 GMT</pubDate></item><item><title><![CDATA[Reply to 布鲁氏菌分析 on Thu, 28 Jul 2022 11:29:04 GMT]]></title><description><![CDATA[<p dir="auto"><a href="https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0882401022000158" rel="nofollow ugc">https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0882401022000158</a></p>
]]></description><link>http://an.forum.genostack.com/post/1755</link><guid isPermaLink="true">http://an.forum.genostack.com/post/1755</guid><dc:creator><![CDATA[anneng]]></dc:creator><pubDate>Thu, 28 Jul 2022 11:29:04 GMT</pubDate></item><item><title><![CDATA[Reply to 布鲁氏菌分析 on Thu, 28 Jul 2022 10:15:58 GMT]]></title><description><![CDATA[<p dir="auto">您好！青海省地方病预防控制所的2022年度省级布病防治实验室及重点监测县布病防控能力提升项目将于2022年8月9日开标，附件为授权书格式，以下为本次招标文件的要求文件，所有文件请帮忙将扫描件先发给我，纸质版请寄到：陕西省西安市雁塔区曲江大道167号龙湖紫都城速递易，李魏强18092945052。多谢！<br />
1、授权书（必须有）； <br />
2、营业执照复印件； <br />
3、制造商的资格声明、公司简介； <br />
4、技术白皮书、质量管理体系认证证书（ISO9001）、环境管理体系认证证书（ISO14001）、职业健康管理体系认证证书（18001）、国家强制性认证（3C认证）、CE认证、FDA认证和质量保证书； <br />
5、完整的产品检测报告； <br />
6、投标产品专利技术； <br />
7、产品列入政府采购环保产品清单和政府采购节能产品清单的，提供入围产品所属期、所在页的截图作为证明材料； <br />
8、制造厂商小型、微型企业声明函； <br />
9、售后服务承诺条款证明原件;（必须有）； <br />
10、进口设备原产地证明文件；（进口设备必须有、国产设备不用管）； <br />
11、产品价格及技术参数响应情况(回复至邮件)； <br />
12、产品原始彩页资料各1份、每页请加盖红章。  <br />
请贵公司将以上资料加盖红章后，扫描后回复至我的电子邮箱。谢谢！</p>
]]></description><link>http://an.forum.genostack.com/post/1754</link><guid isPermaLink="true">http://an.forum.genostack.com/post/1754</guid><dc:creator><![CDATA[anneng]]></dc:creator><pubDate>Thu, 28 Jul 2022 10:15:58 GMT</pubDate></item></channel></rss>