• image: anneng01:8090/angs/molecular_genetic_analysis:api_01
• volumn: /workspace/angs_molecular_genetic_analysis_api/instance
• port: 5667

完整的启动命令

docker run -d \
-p 5667:5667 \
-v /ceph_disk3/lx/temp/instance:/workspace/angs_molecular_genetic_analysis_api/instance \
anneng01:8090/angs/molecular_genetic_analysis:api_01

备注:

1. instance目录下包含
   • config.py: 部署时需要修改内部pg和redis配置
   • supervisord.conf: 使用归档文件即可
   • log: 空目录
2. 需要的配置文件参考服务器 /ceph_disk3/lx/temp/instance 下内容
3. 关于镜像tag名称在正式使用时可能会有更新(项目并未完全完成)

验证:

1. 使用服务器内部文件(可在instance目录下放置test_data目录,并将测试数据放入)

使用post方式请求接口: http://103.114.101.5:5667/load
请求参数(json格式):

{
    "vcf":"/workspace/angs_molecular_genetic_analysis_api/instance/test_data/n5000.vcf.gz",
    "fasta":"/workspace/angs_molecular_genetic_analysis_api/instance/test_data/Nitab-v4.5_genome_Chr_Edwards2017.fasta"
}