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      anneng 最后由 anneng 编辑

      https://bmcbioinformatics.biomedcentral.com/articles/10.1186/s12859-017-1723-8
      SparkBLAST: scalable BLAST processing using in-memory operations

      5652360b-aae1-4d09-b344-affb7fdca9e8-image.png

      391639d8-adc2-4fd9-917e-373fa8c5b792-image.png
      https://github.com/sparkblastproject/v2

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        anneng 最后由 编辑

        https://ieeexplore.ieee.org/abstract/document/4736761
        Matsunaga A, Tsugawa M, Fortes J. Cloudblast: Combining mapreduce and virtualization on distributed resources for bioinformatics applications. In: Intl. Conf. on eScience (eScience’08). Los Alamitos: IEEE Computer Society.2008. p. 222–9.
        Hadoop的方案

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          anneng 最后由 anneng 编辑

          High throughput BLAST algorithm using spark and cassandra
          cores2020.pdf
          22a6ec33-e6ad-4970-8a20-f423468762ae-image.png
          Sparky‑Blast
          a7a1e3f9-9220-4eb9-b8af-1cd4d68156df-image.png
          https://github.com/Sherynan/SparkyBlast

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            anneng 最后由 编辑

            https://sci-hub.st/10.1109/CCGrid49817.2020.00-39
            SparkLeBLAST: Scalable Parallelization of
            BLAST Sequence Alignment Using Sparkyoussef2020.pdf

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