三黍lims部署记录

zhanglu

1. 启动mysql;

注意设置：

--lower-case-table-names=1
set global log_bin_trust_function_creators=TRUE;

docker run -d \
-v /cephfs_data/genostack_v3/genostack_lims/mysql/data:/var/lib/mysql \
-p 3306:3306 --name mysql -e MYSQL_ROOT_PASSWORD=super mysql:8.0.33 --lower-case-table-names=1

启动需等待几分钟后才能远程连接；

2. 启动redis:

docker run -p 6379:6379 -v /opt/genostack_v3/genostack_redis/redis-data/:/dataredis:5.0.5 redis-server

3. 启动lims

jdk1.8:
方式一：jar包：
将配置文件和jar包放置同一路径：
java -Djava.security.egd=file:/dev/./urandom -jar lims5-ms-sanshu-14.1.3.jar
方式二：docker
Dockerfile

FROM dockerhub.genostack.com/sanshu/limsbaseimage:v1.0
VOLUME /data
VOLUME /app/files

#具体项目jar名字，jar和Dockerfile在一个目录
ADD *.jar /app/lims5-ms-sanshu-14.1.3.jar

WORKDIR /app

RUN mkdir -p /app/logs
ADD application.yml /app/application.yml
ADD application-dev.yml /app/application-dev.yml

#根据项目情况实际调整，建议为项目内存的一半
ENV JAVA_OPTS="\
-Xmx9082m \
-Xms9082m"

ENTRYPOINT exec java $JAVA_OPTS -Djava.security.egd=file:/dev/./urandom  -jar lims5-ms-sanshu-14.1.3.jar.jar