暗能星系
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    张渌
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    • Z
      zhanglu 最后由 编辑

      Caused by: org.postgresql.util.PSQLException: ERROR: duplicate key value violates unique constraint "PK_METADATA_JOURNAL"
      Detail: Key ("METADATA_JOURNAL_ID")=(3106732) already exists.
      at org.postgresql.core.v3.QueryExecutorImpl.receiveErrorResponse(QueryExecutorImpl.java:2440)
      at org.postgresql.core.v3.QueryExecutorImpl.processResults(QueryExecutorImpl.java:2183)
      ... 40 more

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      • Z
        zhanglu 最后由 编辑

        2024-07-03 06:31:14.942 [INFO][9] startup/startup.go 451: Hit error connecting to datastore - retry error=Get "https://10.233.0.1:443/api/v1/nodes/foo": net/http: TLS handshake timeout

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        • Z
          zhanglu 最后由 编辑

          ssh-rsa AAAAB3NzaC1yc2EAAAADAQABAAABAQDAJGzJ+KvXx0xDC8aJw+/5jvI8+yHWMj54I3r9xBnmG+ICjusUV++zevR0NJJyKzTNH62aug3m2J+v7BxoiCLDN0SCwDI8XP0UV5WaMymCYSfpWoh9/WepLO1rAGVnonhI6zDCyy4JaJCcMiYR8D/XgfMrRBP/46Zwj+9JlofKTBk1cwiKmx1gcvGDcGMojNP+ibngCNTdhA56yYwlPXmgjXXKI1O5FAp3OEbhIE0R1VImSkmR2NHNNiQVtcvg4EIEp0ZD4y0dLDQ5t9CtiCzRGryhZSjyoIhdqtyhMGn+ITvMawhygh2BEgaLcNIPiTVF6aQEbH5rG86Nkgbi+LTZ root@localhost

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          • Z
            zhanglu 最后由 编辑 

            "default-runtime": "nvidia",
"runtimes": {
    "nvidia": {
        "path": "/usr/bin/nvidia-container-runtime",
        "runtimeArgs": []
    }
}
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            • Z
              zhanglu 最后由 编辑

              distribution=$(. /etc/os-release;echo $ID$VERSION_ID)
              curl -s -L https://nvidia.github.io/nvidia-docker/gpgkey | sudo rpm --import -
              curl -s -L https://nvidia.github.io/nvidia-docker/$distribution/nvidia-docker.repo | sudo tee /etc/yum.repos.d/nvidia-docker.repo
              sudo yum install -y nvidia-docker2
              sudo systemctl restart docker

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              • Z
                zhanglu 最后由 编辑

                wget https://console.genostack.com/php_sours/process_and_input/2024_05_24/17165442884169.wdl
                wget https://console.genostack.com//php_sours/process_and_input/2024_03_06/17097083111747.wdl

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                • Z
                  zhangfanglin @zhanglu 最后由 编辑

                  tt.txt

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                  • Z
                    zhangfanglin @zhangfanglin 最后由 编辑

                    tt.txt

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                    • Z
                      zhanglu 最后由 编辑

                      pkill docker
                      iptables -t nat -F
                      ifconfig docker0 down
                      brctl delbr docker0
                      docker -d

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                      • Z
                        zhanglu 最后由 编辑

                        58 | Kinases
                        57 | KSEA
                        56 | ms-stem
                        55 | chordDiagram
                        54 | circosHeatmap
                        53 | NMF
                        52 | dumbbell
                        44 | ms-sankey

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                        • Z
                          zhanglu 最后由 编辑

                          url = f"{url}/ms_jk/query_app_version"

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                          • Z
                            zhanglu 最后由 编辑

                            ms-kinases.yaml 32048
                            ms-ksea.yaml 32047
                            cat ms-stem.yaml 32046
                            cat ms-chorddiagram.yaml 32045
                            cat ms-circos-heatmap.yaml 32044
                            cat ms-nmf.yaml 32043
                            cat ms-dumbbell.yaml 32041
                            cat ms-sankey.yaml 32042

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                            • Z
                              zhanglu 最后由 zhanglu 编辑

                              yum remove docker-ce docker-ce-cli containerd.io
                              yum list docker-ce --showduplicates | sort -r

                              yum install -y docker-ce-24.0.7-1.el8 docker-ce-cli-24.0.7-1.el8 containerd.io

                              systemctl start docker

                              docker run -it dockerhub.genostack.com:8090/library/ubuntu:20.04 bash
                              ms-chorddiagram NodePort 10.233.57.199 <none> 5000:31045/TCP 33m
                              ms-circos-heatmap NodePort 10.233.45.213 <none> 5000:31044/TCP 33m
                              ms-color NodePort 10.233.39.0 <none> 5000:32001/TCP 34m
                              ms-dumbbell NodePort 10.233.55.63 <none> 5000:31041/TCP 33m
                              ms-protein-location NodePort 10.233.24.185 <none> 5000:32004/TCP 33m
                              ms-protein-ppi NodePort 10.233.59.111 <none> 5000:31025/TCP 33m
                              ms-roc NodePort 10.233.37.136 <none> 5000:31009/TCP 33m
                              ms-sankey NodePort 10.233.48.75 <none> 5000:31042/TCP 33m
                              public-services NodePort 10.233.10.74 <none> 5000:31040/TCP 35m

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                              • Z
                                zhanglu @zhanglu 最后由 zhanglu 编辑

                                curl 10.233.57.199:5000/ms_jk/query_app_version
                                curl 10.233.45.213:5000/ms_jk/query_app_version
                                curl 10.233.39.0:5000/ms_jk/query_app_version
                                curl 10.233.55.63:5000/ms_jk/query_app_version
                                curl 10.233.24.185:5000/ms_jk/query_app_version
                                curl 10.233.59.111:5000/ms_jk/query_app_version
                                curl 10.233.37.136:5000/ms_jk/query_app_version
                                curl 10.233.48.75:5000/ms_jk/query_app_version
                                curl 10.233.10.74:5000/ms_jk/query_app_version

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                                • Z
                                  zhanglu 最后由 编辑

                                  api/v1/nodes/foo": net/http: TLS handshake timeout

                                  1 条回复 最后回复 回复 引用 0
                                  • Z
                                    zhanglu 最后由 编辑

                                    https://[10.233.0.1]:443/apis/crd.projectcalico.org/v1/clusterinformations/default": net/http: TLS handshake timeout,

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                                    • Z
                                      zhanglu 最后由 编辑

                                      TASK [bootstrap-os : Install libselinux python package] ********************************************************
                                      fatal: [node4]: FAILED! => {"changed": false, "cmd": "dnf install -y python2-dnf", "msg": "Could not import the dnf python module using /usr/bin/python (2.7.18 (default, Aug 25 2021, 15:50:49) [GCC 8.5.0 20210514 (Red Hat 8.5.0-3)]). Please install python2-dnf package or ensure you have specified the correct ansible_python_interpreter.", "rc": 1, "results": [], "stderr": "错误：没有任何匹配: python2-dnf\n", "stderr_lines": ["错误：没有任何匹配: python2-dnf"], "stdout": "上次元数据过期检查：0:32:43 前，执行于 2024年08月24日 星期六 13时57分27秒。\n未找到匹配的参数: python2-dnf\n", "stdout_lines": ["上次元数据过期检查：0:32:43 前，执行于 2024年08月24日 星期六 13时57分27秒。", "未找到匹配的参数: python2-dnf"]}

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                                      • Z
                                        zhanglu 最后由 编辑

                                        retry error=Get "https://10.233.0.1:443/api/v1/nodes/foo": net/http: TLS handshake timeout

                                        1 条回复 最后回复 回复 引用 0
                                        • Z
                                          zhanglu 最后由 编辑

                                          temporary-directory = "$(mktemp -d "$PWD"/tmp.XXXXXX)"

                                          1 条回复 最后回复 回复 引用 0
                                          • Z
                                            zhanglu 最后由 编辑

                                            /cephfs_data/genostack_v3/genostack_cromwell/config
                                            /cephfs_data/genostack_v3/genostack_cromwell_status/config
                                            /cephfs_data/genostack_v3/genostack_websocket/config/.env

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