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    序列注释分析一例

    生物信息分析
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      anneng 最后由 编辑

      某次测序结果中包括下面的序列 被分别注释为人类和疟原虫:
      AGTATACTTCGTTCAGTTACGTATTGCTAAGGTTAAAAGGTTACACAAACCCTGGTAAGCAGCACCCTTATTGTAACTCTTTCTCAGTAGTGATTTTACACTTCCAGGGTGCAATTTGCTGGTCGGTGTCATCTCCTGCAGGAGACAATGGGCTCCTTGAGGGCTGCGCGTCATGGTCACTGTTGAATCCCCACTGATCCCACCACGGAAGGGTGACTGAGTATTTGTTGAGTGAATAGTCAGGCCACTGAAGTTGGAGGCAGACGCCAGGTACCCCTCTGCCACCCTGTTCATAGGATTATTACTGAGGGAGAAATACAGGAGATGGCCAGGGGCAGGTCCCCACTCCCTCAGTAATAATCTTATGAACAGGTGGCAGGGGTGCCTGGCGTCTGCCTCCGACTTTGCTATCTGACTATTCACTCAACAAATATCAGCTCTCCCGTGTGGATCAGTGGGGCATTCAGCAGTGACCGGGGACAAGGCAGCCCCTCCAAGGAGCCCATTGTCTGCTGCAGGAGACAGACACTGACTCTGGAATTGCACCTGGAAGTGAAATCACTACTGGAGAAAGAGCTACAAATAAGGTGCTGCTTGTCCAGGGTTTGTGTAACCTTTTAACCTTAATAATACGTAGCA

      blast结果
      53a2c4fd-cd24-47ad-ac92-6361de96b313-image.png
      可以发现 该序列的某个部分(blast显示占查询序列的5%) 和疟原虫完全匹配:
      234c2ef4-0da2-4783-b92f-b4c153ab3842-image.png
      这个显然是假阳性 虽然blast的identity为100% 但是占比很低 这种最后肯定也是人的序列

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