关于服务器目录安排

[ice-melt]

data_raid1

• /data_raid1/bioinfo[genostack cromwell 程序目录]
  • ./app/cromwell/cromwell-executions
  • ./app/cromwell/cromwell-executions/data/database
• /data_raid1/dipasm[？似乎是一个软件]
• /data_raid1/git[?]
• /data_raid1/harbor_data[]
• /data_raid1/hdfs_namenode[]
• /data_raid1/ipfs_public_shared[?]
• /data_raid1/postgresql_data[pg数据]
• /data_raid1/postgresql_data.tar.gz[pg数据备份]
• /data_raid1/resurt[?似乎是一些运行日志]

ceph_disk1

• /ceph_disk1/reference_db[参考基因组]
• /ceph_disk1/gene_data/MetaDatabase[生物数据库]
• /ceph_disk1/gene_data/DataArchive[一些数据归档]
• /ceph_disk1/gene_data/DocArchive [一些文档归档]
• /ceph_disk1/gatk_resource_bundle[？数据，待处理]
• /ceph_disk1/1000G_phase1.snps.high_confidence.hg38.vcf.gz[？数据，待处理]

ceph_disk2

• /ceph_disk2/tax_db/kraken_uniq [待删，应该是跑失败的数据]
• /ceph_disk2/bioinfo_workdir[待删，使用bioinfo用户运行命令临时创建的目录]
• /ceph_disk2/app[程序]
• /ceph_disk2/data[程序运行过程的产生的数据]
• /ceph_disk2/software[程序的tar包备份]
• /ceph_disk2/docker_data1[？docker数据]
• /ceph_disk2/genostack_serve[？]
• /ceph_disk2/hadoop_temp[？删]

ceph_disk3

• /ceph_disk3/[规划的新用户家目录]
  • /ceph_disk3/lx[用户]
  • /ceph_disk3/nodebb[用户]
  • /ceph_disk3/lx[用户]
  • /ceph_disk3/wangchao[用户]
  • /ceph_disk3/zfl[用户]
  • /ceph_disk3/zhanglu[用户]
• /ceph_disk3/public_data/upload_static[大文件上传服务的文件上传路径]

待明确

• /ceph_disk1/
  • osd0
• /ceph_disk3/
  • 2patients_nanopore
  • hdfs_datanode
  • osd2

截止20210507，硬盘使用情况

/dev/sde1       7.3T  2.2T  4.7T  32% /ceph_disk3
/dev/sda1       7.3T  5.4T  1.5T  79% /data_raid1
/dev/sdc1       7.3T  6.0T  901G  88% /ceph_disk1
/dev/sdd1       7.3T  2.7T  4.3T  39% /ceph_disk2

[zhangfanglin]

ceph_disk2 （genostack单机版）

• /ceph_disk2/data/hongyuan/mnt/data/public_data/16SModel/ [16S数据模型位置]

• /ceph_disk2/data/hongyuan/mnt/data/public_data [公共文件存储目录]

• /ceph_disk2/data/hongyuan/mnt/data/find_data/ [项目管理中关联服务器文件对应目录]

• /ceph_disk2/data/hongyuan/mnt/data/ [项目管理中上传样本数据对应目录]

• /ceph_disk2/data/hongyuan/mnt/data/tmp [项目管理中启动流程后整理流程所需文件对应目录]

• /ceph_disk2/data/hongyuan/mnt/data/resurt/ [数据分析中溯源、系统发育树应用输出对应目录]