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    流程不完整问题(四医大)

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    • Z
      zhangfanglin 最后由 zhangfanglin 编辑

      问题描述:

      流程节点完整,提交后台跑流程时报错,情况如下:

      webwxgetmsgimg.jpg

      问题跟踪:
      1、找到处理流程的代码,反复核查,代码无误。
      2、找到流程模版中的数据一一核对情况如下:

      f3951e43-db92-4a3f-8e0f-9df7250c90f9-image.png

      图上说明:
      在连线3中出现的FastqcSigle_1名称在节点中根本没出现,所以在后台拼接流程转WDL时会断掉之后的所有节点,所以就出现了本次的流程不完整问题。

      本次问题出现情况:
      1、模板数据都是手动COPY,然后发布。
      2、COPY数据之后进行手动二次修改。

      场景优化:
      后续模版流程转系统完成,模版流程配置完成后,添加发布功能,将流程发布出来。

      现场解决方案(四医大):
      1、登录现场机器
      2、下载附件update_def_wdl.sql
      3、执行sql(将 -f的参数替换成下载的sql,路径保持一致)

      psql "host=localhost port=5435  user=postgres password=anneng@1235_Jike2015 dbname=qiime" -f ./update_def_wdl.sql
      
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      • Z
        zhangfanglin @zhangfanglin 最后由 编辑

        @zhangfanglin
        续
        现场解决方案(四医大):
        4、打开浏览器进入系统 项目管理》》项目列表》流程选择配置
        注:如果在执行sql之前在当前界面,需要刷新界面
        5、删除之前的流程点击添加选择单端流程 如图:
        b3f21569-ba3d-4cee-960c-9d7fda720b15-image.png

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        • Z
          zhangfanglin 最后由 编辑

          更新数据库(流程连线有问题)
          update_def_wdl.sql

          1 条回复 最后回复 回复 引用 0
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