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    肿瘤NGS数据分析
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      anneng 最后由 编辑

      https://www.illumina.com/products/by-type/informatics-products/basespace-sequence-hub/apps/edico-genome-inc-dragen-somatic-pipeline.html

      bf40668f-5bde-4b8c-b34e-b763626542a9-image.png

      bbb5afdb-c0fb-4f3e-ad21-481928b5f1c2-image.png

      如果没有体细胞样本 单肿瘤样本的vcf包括了胚系突变和体细胞突变 需要公共的数据库把胚系突变过滤掉
      从医臻给的vcf看 里面有个somatic标志 似乎已经确认了哪些是体细胞突变

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        anneng 最后由 编辑

        https://support.illumina.com/content/dam/illumina-support/documents/documentation/software_documentation/dragen-bio-it/dragen-bio-it-platform-v3.5-user-guide-1000000111887-00.pdf

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