暗能星系
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    张渌
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    • Z
      zhanglu 最后由 编辑 

      "default-runtime": "nvidia",
"runtimes": {
    "nvidia": {
        "path": "/usr/bin/nvidia-container-runtime",
        "runtimeArgs": []
    }
}
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      • Z
        zhanglu 最后由 编辑

        distribution=$(. /etc/os-release;echo $ID$VERSION_ID)
        curl -s -L https://nvidia.github.io/nvidia-docker/gpgkey | sudo rpm --import -
        curl -s -L https://nvidia.github.io/nvidia-docker/$distribution/nvidia-docker.repo | sudo tee /etc/yum.repos.d/nvidia-docker.repo
        sudo yum install -y nvidia-docker2
        sudo systemctl restart docker

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        • Z
          zhanglu 最后由 编辑

          wget https://console.genostack.com/php_sours/process_and_input/2024_05_24/17165442884169.wdl
          wget https://console.genostack.com//php_sours/process_and_input/2024_03_06/17097083111747.wdl

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          • Z
            zhangfanglin @zhanglu 最后由 编辑

            tt.txt

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            • Z
              zhangfanglin @zhangfanglin 最后由 编辑

              tt.txt

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              • Z
                zhanglu 最后由 编辑

                pkill docker
                iptables -t nat -F
                ifconfig docker0 down
                brctl delbr docker0
                docker -d

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                • Z
                  zhanglu 最后由 编辑

                  58 | Kinases
                  57 | KSEA
                  56 | ms-stem
                  55 | chordDiagram
                  54 | circosHeatmap
                  53 | NMF
                  52 | dumbbell
                  44 | ms-sankey

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                  • Z
                    zhanglu 最后由 编辑

                    url = f"{url}/ms_jk/query_app_version"

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                    • Z
                      zhanglu 最后由 编辑

                      ms-kinases.yaml 32048
                      ms-ksea.yaml 32047
                      cat ms-stem.yaml 32046
                      cat ms-chorddiagram.yaml 32045
                      cat ms-circos-heatmap.yaml 32044
                      cat ms-nmf.yaml 32043
                      cat ms-dumbbell.yaml 32041
                      cat ms-sankey.yaml 32042

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                      • Z
                        zhanglu 最后由 zhanglu 编辑

                        yum remove docker-ce docker-ce-cli containerd.io
                        yum list docker-ce --showduplicates | sort -r

                        yum install -y docker-ce-24.0.7-1.el8 docker-ce-cli-24.0.7-1.el8 containerd.io

                        systemctl start docker

                        docker run -it dockerhub.genostack.com:8090/library/ubuntu:20.04 bash
                        ms-chorddiagram NodePort 10.233.57.199 <none> 5000:31045/TCP 33m
                        ms-circos-heatmap NodePort 10.233.45.213 <none> 5000:31044/TCP 33m
                        ms-color NodePort 10.233.39.0 <none> 5000:32001/TCP 34m
                        ms-dumbbell NodePort 10.233.55.63 <none> 5000:31041/TCP 33m
                        ms-protein-location NodePort 10.233.24.185 <none> 5000:32004/TCP 33m
                        ms-protein-ppi NodePort 10.233.59.111 <none> 5000:31025/TCP 33m
                        ms-roc NodePort 10.233.37.136 <none> 5000:31009/TCP 33m
                        ms-sankey NodePort 10.233.48.75 <none> 5000:31042/TCP 33m
                        public-services NodePort 10.233.10.74 <none> 5000:31040/TCP 35m

                        Z 1 条回复 最后回复 回复 引用 0
                        • Z
                          zhanglu @zhanglu 最后由 zhanglu 编辑

                          curl 10.233.57.199:5000/ms_jk/query_app_version
                          curl 10.233.45.213:5000/ms_jk/query_app_version
                          curl 10.233.39.0:5000/ms_jk/query_app_version
                          curl 10.233.55.63:5000/ms_jk/query_app_version
                          curl 10.233.24.185:5000/ms_jk/query_app_version
                          curl 10.233.59.111:5000/ms_jk/query_app_version
                          curl 10.233.37.136:5000/ms_jk/query_app_version
                          curl 10.233.48.75:5000/ms_jk/query_app_version
                          curl 10.233.10.74:5000/ms_jk/query_app_version

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                          • Z
                            zhanglu 最后由 编辑

                            api/v1/nodes/foo": net/http: TLS handshake timeout

                            1 条回复 最后回复 回复 引用 0
                            • Z
                              zhanglu 最后由 编辑

                              https://[10.233.0.1]:443/apis/crd.projectcalico.org/v1/clusterinformations/default": net/http: TLS handshake timeout,

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                              • Z
                                zhanglu 最后由 编辑

                                TASK [bootstrap-os : Install libselinux python package] ********************************************************
                                fatal: [node4]: FAILED! => {"changed": false, "cmd": "dnf install -y python2-dnf", "msg": "Could not import the dnf python module using /usr/bin/python (2.7.18 (default, Aug 25 2021, 15:50:49) [GCC 8.5.0 20210514 (Red Hat 8.5.0-3)]). Please install python2-dnf package or ensure you have specified the correct ansible_python_interpreter.", "rc": 1, "results": [], "stderr": "错误：没有任何匹配: python2-dnf\n", "stderr_lines": ["错误：没有任何匹配: python2-dnf"], "stdout": "上次元数据过期检查：0:32:43 前，执行于 2024年08月24日 星期六 13时57分27秒。\n未找到匹配的参数: python2-dnf\n", "stdout_lines": ["上次元数据过期检查：0:32:43 前，执行于 2024年08月24日 星期六 13时57分27秒。", "未找到匹配的参数: python2-dnf"]}

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                                • Z
                                  zhanglu 最后由 编辑

                                  retry error=Get "https://10.233.0.1:443/api/v1/nodes/foo": net/http: TLS handshake timeout

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                                  • Z
                                    zhanglu 最后由 编辑

                                    temporary-directory = "$(mktemp -d "$PWD"/tmp.XXXXXX)"

                                    1 条回复 最后回复 回复 引用 0
                                    • Z
                                      zhanglu 最后由 编辑

                                      /cephfs_data/genostack_v3/genostack_cromwell/config
                                      /cephfs_data/genostack_v3/genostack_cromwell_status/config
                                      /cephfs_data/genostack_v3/genostack_websocket/config/.env

                                      1 条回复 最后回复 回复 引用 0
                                      • Z
                                        zhanglu 最后由 编辑

                                        ssh-rsa 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 admin@example.com

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                                        • Z
                                          zhanglu 最后由 编辑

                                          ssh-rsa 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 root@localhost.localdomain

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                                          • Z
                                            zhanglu 最后由 zhanglu 编辑

                                            Warning FailedCreatePodSandBox 102s (x4 over 8m23s) kubelet Failed to create pod sandbox: rpc error: code = Unknown desc = failed to create a sandbox for pod "task-427ed3bc-rtvhm": operation timeout: context deadline exceeded

                                            1 条回复 最后回复 回复 引用 0
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