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    Faster NGS Duplicate Marking

    生物信息分析
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      anneng 最后由 编辑

      https://medium.com/grail-eng/faster-ngs-duplicate-marking-d7a1fd287f46
      ef045a74-5b12-421b-a911-7ecba508336d-image.png
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      Picard¹ and Sambamba 的算法类似
      SAMTools (rmdup)

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        anneng 最后由 编辑

        https://bmcbioinformatics.biomedcentral.com/articles/10.1186/s12859-016-1097-3#:~:text=PCR duplicates are sequence reads,duplicates appear proportionately more often
        这个文章说去重对后面的variant call 结果影响不大 但是这样能明显减少分析的数据量

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